如果说重点学校制度使得学校之间产生了差距，那么择校和择校费制度则使得学校之间的差距越拉越大。要实现义务教育均衡发展，就要着力解决择校问题。义务教育阶段必须坚持“就近、免试入学”原则。在公立小学、初中就近入学所辖片区的划分上，应尽力达到生源分配的相对均衡，同时，在小学、初中同一年级不同班级学生的安排上采取相对公平的电脑派位制，防止择校现象的蔓延。为了逐步解决择校问题，可以实行示范性高中、重点高中招生指标按各初中所招本学区在校生比例，平均分配到各校，单划分数线录取。山东、辽宁等地实践表明，一定比例的示范性高中和重点高中指标到校，确能引导城市初中均衡配置办学资源，确保生源的平均分配。
5.实行城乡一元化体制改革，促进城乡均衡发展
破除城乡二元体制是建设社会主义新农村和缩小城乡差距的关键。当前，我国经济社会发展已经从总体上进入了“工业反哺农业、城市支援农村”的新阶段，统一城乡义务教育管理体制，搭建城市与农村义务教育共同发展的统一平台，已经是时代发展的要求。
建立城乡统一的义务教育管理体制，在财政拨款、学校建设、教师配置等方面要实现均衡。因为城市方面基础较好，关键是改革农村义务教育管理体制，特别是教育经费管理和师资队伍管理两大方面。