ユーロ・ブリタニアとユーロピア共和国連合（E      U      ）の戦争は大きな転機を迎えようとしていた－－      E      U      を混乱に陥れたテロリスト「方舟の船団」      それがユーロ・ブリタニアの計略だと見破ったアキトたちは、その本拠である大型飛行艇ガリア・グランデへ乗り込み、因縁の敵・アシ ュレイと激しい戦闘を繰り広げる      戦闘を見守るレイラだったが、突如アキトたちからの連絡が途絶する      必死の通信を試みるも、アキトたちが不在のヴァイスボルフ城がユーロ・ブリタニアの襲撃を受ける      戦力も無く、兵士もいないレイラたちの前に、聖ミカエル騎士団総帥のシンが操る黄金のナイトメアフレーム・ヴェルキンゲトリクスが森を駆け、圧倒的な攻撃力で迫りくる      wZERO部隊が絶体絶命の時、首都パリでは、スマイラス将軍によるクーデターが決行される      E      U      政権を掌握したスマイラスは国民に宣言する      「レイラは死んだ」      シンの絶望、レイラの悲しみ、そしてアキトの怒りを飲み込んで運命の歯車が回る